Sistema web para identificação e busca de ilhas CPG na base HCGP e buscas individuais
Título [PT]: Sistema web para identificação e busca de ilhas CPG na base HCGP e buscas individuais
Autor: Júnio César Rosa
Palavras-Chave [PT]: Ilhas CpG, Metilação de DNA, EMBOSS, Banco de dados HCGP, Marcadores Moleculares, Alinhamento de Sequências.
Área de concentração:
Titulação:
Banca:
Prof. Dr. Nelson José Freitas da Silveira (Orientador)
Prof. Luiz Eduardo da Silva
Profa. Cibele Marli Cação Paiva Gouvêa
Resumo:
Este trabalho apresenta o desenvolvimento de um sistema web para classificação de Ilhas CpG em diversos tecidos tumorais, usando banco de dados à base de sequências do Genoma Humano do Câncer (HCGP). Utilizando técnicas de alinhamento de sequências entre a sequência fornecida pelo usuário e as sequências presentes no HCGP. O pacote EMBOSS, utilizado no sistema, busca alinhar as sequências do banco e retornar para o usuário as sequências que tenham semelhança significativa entre as do banco e do usuário para com as do banco. Com as sequências retornadas pelo sistema será possível classificar o grupo de tecidos tumorais que a sequência fornecida pelo usuário pertence, dizendo também se a sequência se enquadra nas especificações de Ilhas CpG.
Data: 29-08-2013
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